這些惡意功能之一是程式與在相同資料類型上運作的第三方軟體之間刻意的不相容性。

一種相當常見的不相容性是使用秘密格式或協定。這直接阻止或阻礙使用者切換到任何其他程式——特別是切換到自由軟體，自由軟體可以解放執行該軟體的裝置。

除了刻意反競爭之外，秘密格式還會讓使用者的數位資料面臨風險。例如，如果停止對可以讀取舊資料的專有軟體的支援，則檢索舊資料將變得非常困難。

另一種不相容性發生在當系統使某些重要的操作變得非常繁瑣或緩慢時，這些操作對於將資料遷移到任何其他系統是必要的，以至於對於大量資料來說是不可行的。

更廣泛地說，主要的科技公司傾向於對其產品的互操作性施加人為限制，以壟斷市場，而這通常是透過專有惡意軟體實現的。

• 2023-11

  Chamberlain 集團 阻止使用者在其車庫門開啟器上使用第三方軟體。這是對使用自由軟體的蓄意攻擊。官方車庫門開啟器專有行動應用程式現在也充斥著廣告，包括向上銷售其其他服務和裝置。

• 2018-03

  在 MacOS 和 iOS 中，將影像從「照片」格式轉換為自由格式的程序非常繁瑣且耗時，以至於使用者如果有很多影像就會放棄。

• 2016-05

  iWork（可在 MacOS、iOS 和 iCloud 上運作的辦公軟體）使用秘密格式，並且不提供將它們轉換為或從開放文件格式轉換的方法。自 iWork 格式首次推出以來，已更改過多次。這可能產生了阻礙逆向工程努力的效果，從而阻止自由軟體完全支援它們。

  iWork 格式被認為不適合文件保存。

• 2016-02

  一個運行專有程式碼的心律調節器配置錯誤，可能導致植入者死亡。為了找出問題所在並加以修復，該人員需要入侵設定心律調節器參數的遠端裝置（可能侵犯了製造商在 DMCA 下的權利）。如果該系統運行的是自由軟體，則可以更快地修復它。